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-도서목차-

제1 장 후성유전학과 DNA 메틸화 / 1
01. 후성유전/후성유전학이란? 1
02. 유핵생물에서의 DNA 메틸화 양상 3
03. DNA 메틸화란 무엇인가? 4
04. 포유류 게놈에서 메틸화가 갖는 기능 5

제2 장 CpG islands의 정의와 CpG islands 메틸화 / 9
01. CpG islands란 무엇인가? 9
02. CpG island의 정의 기준 12
03. CpG islands 메틸화란 무엇인가? 14
04. 조직 특이유전자의 발현억압에는 CpG islands 메틸화가관여하는가? 15

제3 장 무엇이 CpG islands의 메틸화를 초래하는가? / 17
01. 바이러스와 메틸화 18
02. 니켈과 메틸화 21
03. 염증과 메틸화 22
04. 노화와 메틸화 22
05. 국소적인 메틸화 발단인자 25
06. 특정 종양에서 특정 유전자의 변이로 인해 초래되는 유전체전반적인 DNA 과메틸화 26
07. 무엇이 CpG islands를 메틸화로부터 보호하는 것일까? 27

제4 장 메틸화가 잘 일어나는 CpG islands와 안 일어나는 CpG
islands 간에는 어떠한 구조적 차이가 있는 것일까? / 31
01. CpG island 내 전사인자결합부위 농도 33
02. 전사활성도 34
03. DNA 시퀀스상의 구조적 차이 34
04. 구아닌 및 싸이토신 분포의 DNA 가닥 비대칭성 35
05. 반복 DNA 엘리멘트와의 관련 36
06. 크로마틴 구조상의 차이 36

제5 장 CpG islands 메틸화에 의한 유전자 발현 억제 기전 / 39

제6 장 DNA 메틸기전달효소 / 43
01. DNA 메틸화 패턴의 보존 45
02. 보존성 메틸기전달효소, Dmnt1 46
03. 신생 메틸화전달효소, DNMT3A, DNMT3B 55
04. DNMT2 59
05. DNMT3L 60
06. Dnmt1o 63

제7 장 DNA 메틸기전달효소의 발현 / 65
01. 정상 조직 및 암종 세포주에서의 DNA methyltransferases의 발현 65
02. 정상 및 종양세포에서 세포주기 측면에서 살펴본 DNA
methyltransferases의 발현 67
03. 신생 DNA에서의 메틸화 동역학 70

제8 장 포유류의 초기 발생과정에서 일어나는 후성유전적재편성 / 71
01. 발생단계에서 DNA 메틸기전달효소들의 발현 양상 71
02. 배아 발생기의 후성유전적 변화 74

제9 장 X염색체 불활성화 조절 85
01. Xist의 역할 (role of Xist) 85
02. Tsix의 역할 (role of Tsix) 86
03. Xic의 역할 (role of Xic) 87
04. X염색체 불활성화 과정에서 초기 크로마틴 변화와 Polycomb그룹 단백질의 역할 88

제10 장 후성유전적 질환으로서의 암 91
01. 종양억제 유전자의 억압 93
02. 유전체 전반에 걸친 저메틸화 95
03. 염색질(크로마틴) 관련 유전자의 유전적 결함 96
04. 암세포에는 얼마나 많은 CpG islands가 메틸화되어 있을까? 96
05. 후성유전적 변화에 의한 암 발생 98
06. 실험적 생쥐 모델을 통해서 살펴 본 DNA 메틸화 변화와 장선종발생과의 관계 100
07. 원발종양과 세포주 간의 메틸화 변화 102

제11 장 CpG island 메틸화에 의해 전사가 차단될 수 있는 유전
자들 / 105
01. 인체암에서 CpG island 과메틸화에 의해 불활성화되는유전자들의 리스트 107
02. 식도 및 위의 정상 세포 또는 암세포에서 DNA 메틸화 타겟이되는 유전자들 109
03. 대장암에서 메틸화가 일어나는 유전자들 115
04. 간암에서 메틸화가 일어나는 유전자들 118
05. “운전사” 메틸화와 “승객” 메틸화 120

제12 장 후성유전학적 변화와 유전적 변화 간의 상호작용 / 123
01. 후성유전적 변화는 유전자적 변화에 어떻게 영향을 끼치는가? 123
02. 메틸싸이토신에 의한 유전자 변이 124
03. 유전자적 변이가 후성유전자적 변화에 어떻게 영향을 끼치는가? 126

제13 장 저메틸화의 위상학적 분석: 저메틸화는 유전체의 어디에서 일어나는가? / 129
01. 유전체 전반에 걸친 저메틸화: 암종과의 관련성 132
02. 특정 유전자 또는 유전체 시퀀스의 저메틸화: 암종과의 관련성 134
03. 저메틸화를 초래하는 과정들 140
04. 저메틸화가 야기하는 세포 수준에서의 기능적 결과 145
05. 저메틸화가 갖는 임상적 의미 147
06. 메틸화 상태에 영향을 미치는 외부적 요소들 151
07. 노화 관련 메틸화 변화와 암종 관련 메틸화 변화의 유사성 152
08. 국소과메틸화와 유전체 저메틸화의 상호관계 154

제14 장 DNA 메틸화와 유전체 각인 155
01. 암종의 각인 상실 157

제15 장 메틸화의 관점에서 본 노화와 종양 간의 관계 161
01. 노화 조직에서의 유전체 저메틸화 161
02. 유전자 특이적인 과메틸화 162
03. CpG island 메틸화와 노화 162
04. 노화로 인한 종양의 과메틸화 163

제16 장 대장암의 CpG 섬메틸화 표현형 165
01. CIMP 양성 대장암의 임상병리학적 특성 165
02. CIMP 표현형의 존재 유무에 대한 논란 168
03. 고전적인 CIMP 진단 마커 168
04. 대장암에서 CIMP 진단을 위한 표준화된 접근법 169
05. CIMP 양성암의 전구병변 171
06. 후성유전 불안정성 경로 171

제17 장 위암종과 이상 메틸화 175
01. 위암종에서 DNA 메틸화가 알려진 유전자들 176
02. 다른 장기 암종과 메틸화 빈도 비교 182
03. 위암종의 전 단계 병변에서의 이상 메틸화 184
04. 노화 관련 메틸화 185
05. 메틸화 장암화설 187
06. H. pylori 감염과 위점막의 이상 과메틸화 188
07. SNU 위암 세포주에서의 메틸화 경향 분석 189
08. CIMP 양성 위암종 191
09. EBV 양성 위암종과 CIMP 양성 위암종 195
10. 위암 환자 예후 예측 DNA 메틸화 마커 197

제18 장 메틸화 표지자의 임상적 활용 199
01. DNA 메틸화 검출 199
02. 표지자 개발 203
03. 임상적 적용 205
04. 인체 각 장기 종양에서의 메틸화 양상 210

제19 장 후성유전 질환 221
01. DNA 메틸화 장애 221
02. 각인 유전자 오류에 의한 질환 224
03. 후성유전 질환으로서의 암종 225

제20 장 후성유전 치료 231
01. 후성유전 치료가 갖는 단점 234
02. 후성유전적 치료에서 최근의 진전 235

제21 장 과메틸화는 유전자 불활성화의 원인인가 결과인가? 237
01. DNA 메틸화가 히스톤 메틸화에 앞서는 변화라고 주장하는 근거 238
02. 히스톤 변화가 DNA 메틸 변화에 앞선다는 주장 239
03. 히스톤 코드와 메틸싸이토신 코드의 접속 240

제22 장 히스톤 코드 243
01. 히스톤 메틸기전달효소에 의한 억제 246
02. 히스톤 메틸기전달효소에 의한 활성화 252

제23 장 인체암에서 microRNA의 후성유전학적 변동 255
01. miRNA 생체 내 합성과 침묵기전 255
02. 암종에서 miRNA의 기능과 조절난조 256
03. 인체암에서 miRNA의 후성유전학적 변동 264
04. miRNA의 활용 267

제24 장 DNA 탈메틸화효소 269

제25 장 부록 277
01. Sodium bisulfite modification of DNA 277
02. 조직 슬라이드로부터 DNA 추출하기 286
03. 미세박리(microdissection)를 위한 헤마톡시린-에오신 염색법 287
04. Real Time Quantitative Methylation-Specific PCR을 위한
프라이머(시발체) 및 프로브(소식자) 고안하기 288
05. Quantitative MSP 292
06. 메틸화 특이성 중합효소 연쇄반응(methylation-specific PCR)을
위한 버퍼 만들기 293
07. 메틸화 특이성 중합효소 연쇄반응 294
08. MSP 프라이머 고안하기 295

찾아보기 333
색인 335

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